Yaklaşık 600 sene Süryani Ortadoks Patrikhanesi'nin merkeziymiş. Öncesinde bu alanda bir güneş tapınağı yer alıyormuş. Bölge insanı geçmişte atalarının paganist inançları olduklarını beyan ediyorlar. Manastırda bulunan birçok yapı da buna kanıt gösterilebilir.

Manastırın adı Süryanicede aziz anlamına gelen "Mor" kelimesinden ve safran manastırı deyr-ul-zafaran kelime gurubundan geliyor. Bölgede 15. yüzyıldan itibaren safran yetiştirilmeye başlanmış. Zafaran arapça bir kelime ve safran manasına geliyor.

Yukarı Mezapotamyaya bakan bir tepede yer alıyor. İnsanlar eskiden tapınakları ve manastırları şehirlerden uzağa inşa edermiş. Bunu hem günlük hayatın temposundan uzak tutmak hem de güvenlik sebebiyle yapmışlar.